Статья

В данной статье производится анализ оптимизированного алгоритма Смита-Ватермана для выравнивания геномных последовательностей. Для определения производительности и времени выполнения оптимизированный алгоритм сравниванется с классичесим алгоритмом, так же производится сравнение с классическим алгоритмом в облаке с единственным вычислительным узлом и с классическим облачным алгоритмом, развернутом на платформе Azure с несколькими вычислительными узлами. В статье так же сравнивается усовершенствованная параллельная архитектура MapReduce, развернутая в облаке, и платформа Hadoop. В заключении на основе результатов экспериментов делается вывод о возможностях оптимизированного алгоритма.